人民網(wǎng)長沙9月15日電 一張全基因組育種芯片上均勻分布超12萬個基因位點，平均檢出率達99.5%，重復樣品檢測平均一致性達99.4%，盲樣檢測性能良好，達到國際先進水平……近日，中國荷斯坦牛中高密度基因組選擇育種芯片發(fā)布，標志著我國荷斯坦牛中高密度育種芯片自主設計開發(fā)取得重要突破。

　　據(jù)悉，荷斯坦牛是當前世界奶牛的主要品種，作為單胎大型動物，選擇出優(yōu)秀種公牛是奶牛育種的核心工作。目前，國際上已進入奶牛基因組選擇育種時代，使用中高密度育種芯片，能使種公牛培育周期由約6年縮短至約2年，育種效率顯著提升。

　　“十四五”國家重點研發(fā)計劃項目首席科學家、中國農(nóng)業(yè)大學教授孫東曉就表示，我國近年來加速構(gòu)建和優(yōu)化奶牛基因組選擇育種技術(shù)平臺，但過去完全依賴國外育種芯片，國內(nèi)種牛檢測樣品需要送到國外實驗室檢測，存在技術(shù)“卡點”及生物信息安全風險。

　　在奶牛基因組選擇育種時代，高通量SNP檢測技術(shù)平臺堪稱育種“芯片”，為實現(xiàn)我國國產(chǎn)奶牛育種芯片零的突破，2020年8月，首農(nóng)食品集團北京奶牛中心、中國農(nóng)業(yè)大學、華智生物技術(shù)有限公司啟動奶牛育種芯片自主設計開發(fā)聯(lián)合攻關(guān)。

　　奶牛育種芯片自主開發(fā)經(jīng)歷了一系列科學、嚴謹?shù)脑O計、驗證和反復論證，攻關(guān)團隊基于中國荷斯坦牛群體挖掘驗證了一大批效應顯著的基因突變位點，最終自主設計了涵蓋超12萬個位點（即126K）的育種芯片，該款芯片不僅兼容現(xiàn)有參考群和多款商業(yè)化芯片位點信息，還提高了芯片數(shù)據(jù)填充準確性及奶牛基因組遺傳評估準確性。

　　奶牛126K液相基因組育種芯片通過了專家論證，專家組認為芯片設計科學合理，經(jīng)過檢測驗證、盲樣復檢、多平臺對比、填充效果驗證等多輪測試，驗證程序完善。參照國際同類產(chǎn)品標準，達到產(chǎn)業(yè)化推廣應用水平，可用于荷斯坦牛基因組選擇參考群體的構(gòu)建及種牛評價。

　　“這是我國荷斯坦牛育種領域首款中高密度育種芯片，對提升我國種公牛自主培育能力和水平，進一步完善奶牛種質(zhì)自主評價體系具有重要意義。”中國奶業(yè)協(xié)會副秘書長陳紹祜說。

　　中國奶業(yè)協(xié)會育種專業(yè)委員會主任麻柱說，奶牛育種自主創(chuàng)新聯(lián)盟將率先用上這款芯片，助力保障我國奶牛自主選育體系穩(wěn)定運行，維護生物信息安全，并將進一步提升我國奶牛自主選育能力，助力奶牛種業(yè)振興。（林洛頫、龍宇)